多年纯爱党惨遭牛头人？Eva最终章结局引网友怒喷(3)

故事承接自2012年《福音战士新剧场版：Q》，在第三次冲击（人类补完计划的一部分）被阻止后，淀真嗣、明日香、三号绫波丽（黑丽）来到了第三村落。
Ps：
由于淀真嗣所引发的第三次冲击（外界称为近三冲），陆地被净化，变成了没有有机物的陆地，只有开了反L系统的区域才能够回到人类居住的地方，人类只能因此居住在由反Nerv组织——Wille所建立的几个村落生活。

由于自责自己引发了第三次冲击等原因，自闭少年碇真嗣再次陷入自闭，不吃不喝好几天，也不与人沟通，而三号绫波丽在与村民们交流中，第一次体验到了没有命令的生活，逐渐有了自我感情。她每天与自闭的真嗣交流，并逐渐让碇真嗣恢复了精神，开始接受自己做过的事情。
然而由于三号绫波丽作为凌波系列复制人，不能没有Nerv的LCL（动物体基础形态——生命之水）维护，也就是说她不能在外界生存。在得知自己命不久矣以后，三号绫波丽与碇真嗣告别，并在他面前炸成了LCL，而碇真嗣也终于彻底恢复正常，嚎啕大哭起来，并决定回到Wille组织的空中战舰WUNDER上参与接下来的作战。