人类大脑进化的新机制：神经祖细胞形态的变化促进皮层祖细胞扩增(6)

图四来自本文解读文献Benito-Kwiecinski et. al
为研究细胞形态变化背后的基因表达差别，研究人员对不同阶段的人和大猩猩类脑端脑组织进行了大量的RNA-seq分析，并重点分析了tNE阶段的基因表达差别。大部分基因表达在人和大猩猩中是一致的，说明物种间的大脑发育的高度相似性。在表达差异的基因中，SHROOM3是其中一个。已知SHROOM3介导肌动蛋白actin于NE顶端收缩。SHROOM3染色显示在诱导5天的大猩猩NE细胞表达，但在诱导5天的人NE细胞不表达。与其一致的，actin在诱导5天大猩猩NE顶端更富集。
另外一群表达差异的基因和上皮间质化（epithelial-mesenchymal transition, EMT）相关. EMT是胚胎发育过程中上皮细胞转化成间质细胞的过程。简单来说上皮细胞粘附更紧，不易移动，间质细胞粘附弱，易移动。
（题外3：近十几年来肿瘤学家发现肿瘤转移的过程和EMT类似，提示肿瘤细胞可能利用发育过程中的EMT机制实现转移。肿瘤细胞通过EMT去分化转变成肿瘤干细胞，然后浸润入血液循环系统，再在新的器官植入。等到新的器官周边环境合适，肿瘤干细胞再通过MET（mesenchymal-epithelial transition，EMT反过来的过程）分化出肿瘤细胞，扩增形成转移灶。麻省理工的肿瘤学家Robert Weinberg是上世纪肿瘤基因研究中的主力，发现了第一个致癌基因和第一个抑癌基因。他也是最早研究EMT在肿瘤转移中的作用的科学家之一，研究显示EMT使肿瘤细胞获得干性，脱离上皮组织，实现转移。另外他和Douglas Hanahan所写的发表在Cell上的The hallmarks of cancer，2000和Hallmarks of cancer: the next generation，2011都是史上引用最高的文章之一。
他写的One Renegade Cell: How Cancer Begins是很好的一本肿瘤科普书。）
在分析EMT相关的基因，与细胞形态变化相关又是转录因子（上游调控EMT和形态变化基因表达）的基因中，研究人员很快注意到了ZEB2，一个EMT主调控因子。进一步研究发现ZEB2 mRNA表达在大猩猩诱导5天时达峰值，但在人诱导10天时才达峰值。同样的，ZEB2蛋白在大猩猩类脑端脑组织中也早于人表达。大猩猩NE细胞更早发生EMT转化，细胞黏附蛋白CDH1和EpCAM在大猩猩类脑端脑组织中也早于人的类脑端脑组织降解。