AI诊断技术显身手,疑似病例基因分析只需半小时,将在浙江大规模应用(2)

2023-07-14 来源:旧番剧
不过,全基因组检测方法也有一个缺点。顾斐指出,因为全基因检测涵盖建库、测序和分析三个环节,所以其检测的整体时间比核酸检测要长。
“本次推出的全基因组检测之所以能最大程度降低整体检测时间,是因为新平台无论在硬件还是软件方面都进行了提升,硬件方面主要是应用了更先进的仪器设备,软件方面主要是算法增加了分布式设计。”顾斐向记者解释道。
据了解,更先进的仪器设备由杰毅生物负责,其开发了全自动高通量测序建库仪,可以将患者样本核酸提取、建库和纯化步骤在2小时内无人值守完成。算法提升则是由阿里巴巴达摩院负责,每次测序过程会产生海量数据,基于一系列优化的算法,达摩院将基因分析的时间缩短至半小时/20GB数据量,有效加快样本病例的检测速度。
将在全国推广
据顾斐介绍,全基因组检测分析平台正式上线的第二天,就有6个确诊病例样本正在通过该平台进行基因组序列的测定与分析,这些样本中检测到的新型冠状病毒与最早在武汉确诊病人身上发现的病毒基因组序列高度同源。
“目前来说,(证实该平台)可以有效提升疑似病例确诊效率,及时阻断病毒的传播。”阿里巴巴方面表示。
在此基础上,阿里巴巴达摩院也在积极推动该平台在全国其他地区落地。顾斐表示,“过去两周,我们也在和其它地区疾控中心保持积极沟通。与此同时,我们也在不断优化平台,例如为一线工作人员提供更便捷的操作界面。我们会等整个平台进一步完善后,再进一步推动其它地区的落地,帮助更多的一线人员提升检测效率。”
毒株已成功分离,检测平台也已上线,接下来重中之重,便是疫苗研制和药物筛选,而这需要进行大量的数据分析、大规模的文献筛选和科学超算工作。
阿里巴巴方面表示,未来,全基因组检测分析平台还可以为后续疫苗与药物研发提供支持。
浙江省疾控中心基因测序负责人孙逸也表示,“该平台可以为病毒的解析提供支撑,基于该平台,未来还可以在短时间内将检测范围覆盖整个确诊病例,也为后续疫苗与药物研发打下了坚实基础。”
记者 肖逸思

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