AI结合CRISPR精准控制基因表达
2023-07-14 来源:旧番剧
信用:Unsplash/CC0 公共领域
人工智能可以预测靶向RNA而不是DNA的CRISPR工具的靶上和脱靶活性,根据发表在Nature Biotechnology上的一项新研究。
纽约大学,哥伦比亚大学和纽约基因组中心的研究人员将深度学习模型与CRISPR屏幕相结合,以不同的方式控制人类基因的表达 - 例如轻弹电灯开关以完全关闭它们或使用调光器旋钮部分关闭它们的活动。这些精确的基因控制可用于开发新的基于CRISPR的疗法。
CRISPR是一种基因编辑技术,在生物医学及其他领域有许多用途,从治疗镰状细胞性贫血到设计更美味的芥菜。它通常通过使用一种叫做Cas9的酶靶向DNA来起作用。近年来,科学家们发现了另一种类型的CRISPR,它使用一种叫做Cas13的酶来靶向RNA。
RNA靶向CRISPR可用于广泛的应用,包括RNA编辑,敲低RNA以阻断特定基因的表达,以及高通量筛选以确定有希望的候选药物。纽约大学和纽约基因组中心的研究人员创建了一个使用Cas13进行RNA靶向CRISPR筛选的平台,以更好地了解RNA调控并识别非编码RNA的功能。由于RNA是SARS-CoV-2和流感等病毒的主要遗传物质,因此靶向RNA的CRISPR也有望开发预防或治疗病毒感染的新方法。此外,在人类细胞中,当一个基因表达时,第一步是从基因组中的DNA产生RNA。