全球旅行和接触限制能减缓新冠疫情大流行吗？丨Engineering(5)

3. 人员出行和保持社交距离干预的实施时间
每个国家的非药物干预措施实施时间来自联合国人道主义事务协调办公室评估能力项目组（Assessment Capacities Project of the United Nations Office for the Coordination of Humanitarian Affairs）整理的数据集。该数据集汇集了各国政府为应对COVID-19疫情大流行而采取的措施。该数据集包括从不同数据源收集的二手数据，主要分为5类：封锁、保持社交距离、（国际）旅行限制、公共卫生措施，以及其他社会和经济措施。由于本研究侧重于人员出行和接触相关的干预措施，因此我们提取了每个国家/地区实施封锁、保持社交距离和（国际）旅行限制措施的最早日期，用于本研究。
4. 估计有效再生数
基于先前研究采用的指数增长（EG）方法，我们初步估计每个国家/地区在旅行限制或封锁之前的初始再生数。我们假设疫情早期的流行曲线在未采取人员出行和接触干预措施的时候呈指数增长。在病毒流行的早期，初始再生数与指数增长率有关，用τ表示。指数增长率是通过新感染人数的平均变化来衡量的。因为病例报告数据是整数值，所以我们采用泊松回归估计此参数，即有效再生数Re可估计为：

式中，M表示生成时间分布的离散矩量母函数。该时间分布的生成通常是通过直接计算一个人被感染的时间至其感染他人的时间间隔而获得的。由于本研究无法直接计算生成时间，因此将其替换为服从Weibull分布的病例序列间隔[平均为7 d，标准差（SD）为3.4 d]。该分布来自武汉市疫情初期的估计值。基于上文校正后的报告延迟的流行曲线，我们采用统计软件R中的“R0” 分析包，估计每个国家或地区实施干预措施前的Re。如果某个国家缺失干预日期，则选择首位病例报告至 2020年5月2日前病例报告最多的日期之间的流行曲线估计Re。为了避免对低水平传播或病例数据较少地区产生不准确估计，根据先前的研究，我们对截至2020 年4月28日病例报告数大于或等于500例的国家/地区，采用各自的流行曲线，估计第一波疫情的初始Re。